Le documentaire The Invisible Extinction montre pourquoi la vie moderne décime le microbiome humain, menaçant sa diversité et la santé humaine.

lien vers la vidéo

Bande-annonce "L'extinction invisible" de Microbe Media sur Vimeo .

L'HISTOIRE EN UN COUP D'ŒIL

  • Le film The Invisible Extinction avertit que le microbiome humain est compromis, mettant les humains en danger
  • Le film met en lumière le travail des microbiologistes Dr. Martin Blaser et Gloria Dominguez-Bello - un couple marié - qui enquêtent à la fois sur le problème et sur une solution possible pour sauver la diversité microbienne
  • L'utilisation excessive d'antibiotiques, de césariennes électives et d'aliments transformés entraîne la destruction de notre écologie intérieure », lit-on dans le film.
  • L'augmentation spectaculaire des maladies chroniques, notamment le diabète de type 1, l'asthme, l'obésité, le reflux gastro-œsophagien et les maladies inflammatoires de l'intestin, peut être liée à la perte de diversité bactérienne dans notre intestin.
  • Dominguez-Bello est président de The Microbiota Vault, une initiative mondiale à but non lucratif qui vise à « maintenir la santé à long terme de l'humanité » grâce au stockage et à la préservation d'échantillons et de collections de microbiote

 

Le documentaire The Invisible Extinction sonne l'alarme que le microbiome humain est compromis, mettant les humains en danger. « Les bactéries étaient la forme de vie dominante sur terre. Toute la vie humaine dépend des bactéries », commence le film.

Les chercheurs commencent tout juste à démêler la relation complexe entre les microbes et la santé et la maladie humaines. Cependant, on sait que la diversité microbienne dans l'intestin est une bonne chose, tandis qu'une plus faible diversité dans le microbiome intestinal a été liée à des maladies chroniques comme l'obésité et le diabète de type 2.

En général, la diversité du microbiome intestinal diminue avec l'âge, mais les personnes plus jeunes sont également touchées. Le documentaire cite trois raisons probables à cela : la surconsommation d'antibiotiques, les césariennes électives et les aliments transformés, qui, selon lui, "alimentent la destruction de notre écologie interne".

Bouleverser la diversité microbienne

Le film met en lumière le travail des microbiologistes Dr. Marty Blaser et Gloria Dominguez-Bello - un couple marié - qui abordent à la fois le problème et une solution potentielle pour sauver la diversité microbienne. Steven Lawrence, co-réalisateur et producteur du film, a expliqué à Sloan Science and Film pourquoi, après avoir parlé à de nombreux microbiologistes, il a décidé de faire des recherches de Blaser et Dominguez-Bello le centre du film :

"La recherche de Marty, qui a une portée assez large, définit le problème, tandis que la recherche de Gloria cherche la solution - qu'il s'agisse de préserver les microbes des peuples autochtones ou d'examiner comment nous pouvons rendre les naissances par césarienne moins nocives à long terme, en plus de plaider pour moins." césariennes électives.

Partout dans le monde, il y a des gens qui font des recherches fondamentales importantes qui, espérons-le, mèneront à une vision beaucoup plus nuancée de ce que signifie être en bonne santé. Nous pouvons tous être en bonne santé physique mais avoir des microbiomes très différents ; la diversité en nous-mêmes ainsi qu'au sein de notre espèce mérite d'être protégée et je pense que c'est à cela que sert le travail de Gloria sur le Microbiota Vault [voir ci-dessous].

Le microbiome fait référence à tous les microbes qui vivent dans et sur votre corps. Non seulement il joue un rôle dans la digestion, mais il est également fondamental pour le fonctionnement du système immunitaire. En fait, votre microbiote intestinal affecte presque tous vos systèmes physiologiques.

Dans mon entretien avec Rodney Dietert, professeur émérite d'immunotoxicologie à l'Université Cornell, il explique que nous sommes des êtres microbiens car "plus de 99% de nos gènes proviennent de microbes, pas de nos chromosomes". Ils ont environ 3,3 millions de gènes microbiens, principalement bactériens. Il existe près de 10 millions de gènes microbiens différents dans l'ensemble de la population humaine, vous ne les aurez donc pas nécessairement tous.

De plus, vous avez 22 000 à 25 000 gènes chromosomiques (ces gènes ont été analysés dans le cadre du projet du génome humain), ce qui signifie que vous n'avez qu'environ 2 000 gènes chromosomiques de plus qu'un ver de terre. Comme l'a noté Dietert, nous avons environ 3,3 millions de gènes microbiens, ce qui signifie que génétiquement, nous sommes à plus de 99 % microbiens.

Les peuples autochtones Yanomami sont les plus diversifiés sur le plan microbiologique

Les recherches de Dominguez-Bello et Blaser ont caractérisé le microbiome bactérien des Yanomami, un groupe isolé de peuples autochtones vivant dans la forêt amazonienne, dans les selles, la bouche et la peau. Dans une étude publiée dans Science Advances en 2015, ils ont écrit :

« Ces Yanomami ont un microbiome avec la plus grande diversité de bactéries et de fonctions génétiques jamais trouvée dans un groupe humain.

Malgré leur isolement, qui remonte à plus de 11 000 ans depuis l'arrivée de leurs ancêtres en Amérique du Sud, et aucune exposition connue aux antibiotiques, ils abritent des bactéries porteuses de gènes fonctionnels de résistance aux antibiotiques (AR), y compris ceux qui confèrent une résistance aux antibiotiques synthétiques et sont synténiques. avec des éléments mobilisateurs sont. Ces résultats suggèrent que l'occidentalisation affecte significativement la diversité du microbiome humain..."

Dominquez-Bello pense qu'en étudiant le microbiome de ces peuples indigènes, nous pouvons obtenir des indices sur les fonctions qui se perdent dans les zones urbaines où les modes de vie modernes menacent le microbiome. Dans une interview avec People, elle a expliqué :

« Ce sont des gens qui commencent seulement à s'initier aux pratiques et à la médecine urbaines. Ce sont donc des survivants, car vous pouvez imaginer la mortalité là où il n'y a pas de médicaments. Si vous tombez d'un arbre, vous êtes mort, si vous vous cassez la jambe, vous êtes mort.

Pour 10 mères en travail, une mère ou un bébé meurt. Donc, si vous survivez, vous êtes vraiment un survivant. Et ce sont des gens en bonne santé, parce que les malades sont morts. Nous sommes donc très intéressés à comprendre leur microbiome. Et nous constatons qu'ils sont beaucoup plus diversifiés. En général, la diversité est un indicateur de santé. Plus le microbiome est diversifié, plus l'écosystème est sain.

Pourquoi les césariennes peuvent priver les bébés de leurs microbes

Le film se penche également sur la césarienne, qui altère le microbiote des nourrissons car ils n'entrent pas en contact avec le microbiote vaginal de leur mère lors de l'accouchement. L'accouchement par césarienne est associé à un risque accru de troubles immunitaires et métaboliques, probablement en raison de l'altération du microbiote.

Cependant, les recherches menées par Dominguez-Bello et ses collègues ont révélé que «l'ensemencement vaginal» des naissances par césarienne, lorsqu'il est effectué immédiatement après la naissance, restaure avec succès les microbes maternels, naturalisant ainsi le microbiote du nourrisson. Bien que l'on ne sache pas si la restauration du microbiote des bébés après la naissance entraîne des résultats à long terme pour la santé, Dominquez-Bello veut le savoir. Elle a dit à People :

« Lorsqu'un bébé naît par césarienne élective sans rupture des eaux, il n'est pas exposé au microbiome de la mère dans le vagin. Mais nous avons montré que si nous pouvons au moins partiellement normaliser le microbiome d'un bébé né par césarienne élective en le frottant avec de la gaze imbibée d'un liquide contenant le microbiome de la mère, nous pouvons normaliser le microbiome buccal du bébé au cours de la première année de vie.

Protégeons-nous les enfants contre l'asthme, le diabète de type 1, la maladie cœliaque, les allergies et l'obésité ? Nous menons une étude clinique de cinq ans pour le savoir.

Une exposition précoce peut être la clé de la prévention des maladies

En ce qui concerne l'exposition de la petite enfance, il est également suggéré que des anomalies du microbiome intestinal dans la petite enfance pourraient jouer un rôle dans l'autisme. Blaser a dit à People :

"Nous savons que la prévalence de l'autisme a considérablement augmenté au cours des 80 dernières années. Et c'est une maladie précoce - elle se manifeste dans les premières années. Nous nous intéressons donc à l'idée que le microbiome qui se forme au début de la vie a une connexion avec le cerveau.

Nous savons que le microbiome communique avec le cerveau. Un certain nombre de chercheurs se sont donc intéressés à l'idée qu'un microbiome intestinal précoce anormal pourrait avoir une conversation altérée avec le cerveau et altérer le développement du cerveau.

La leucémie aiguë lymphoblastique (LAL), la forme la plus courante de cancer infantile, pourrait également être liée à des micro-organismes, selon Melvin Greaves de l'Institute of Cancer Research de Londres, au Royaume-Uni.
L'étude de Greaves suggère que l'exposition aux microbes dans la petite enfance peut être le moyen de prévenir la LAL en :

  • Accouchement vaginal (versus césarienne)
  • allaitement maternel
  • Visiter une garderie en tant que bébé
  • contact avec les frères et sœurs plus âgés

 

Des recherches antérieures appuient ces suggestions, y compris une étude de 2002 qui a révélé que les enfants qui passaient plus de temps à la garderie avaient un risque significativement plus faible de LAL. L'allaitement maternel était également associé à un risque plus faible de LAL, tandis que l'introduction du lait maternisé dans les 14 jours suivant la naissance et l'alimentation exclusive au lait maternisé jusqu'à l'âge de six mois étaient positivement associées à la LAL.

Les antibiotiques déciment le microbiome humain

Environ 10 doses d'antibiotiques sont prescrites à chaque personne sur terre chaque année. Même les enfants prennent en moyenne 2,7 antibiotiques à l'âge de 2 ans et 10,9 à l'âge de 10 ans. Cependant, l'exposition commence souvent encore plus tôt, car plus de la moitié des femmes reçoivent des antibiotiques pendant la grossesse ou peu après l'accouchement.

"De plus, il existe un niveau inconnu d'exposition à l'utilisation agricole d'antibiotiques", a déclaré Blaser en 2018 dans le Cleveland Clinic Journal of Medicine. Il pense que l'augmentation spectaculaire des maladies chroniques telles que le diabète de type 1, l'asthme, l'obésité, le reflux gastro-œsophagien et les maladies inflammatoires de l'intestin sont liées à la perte de diversité bactérienne dans nos intestins - causée par une utilisation excessive d'antibiotiques :

«Avant les temps modernes, les microbes étaient transmis de la mère à l'enfant lors de l'accouchement vaginal, du sein de la mère lors de l'allaitement, par contact peau à peau et de la bouche de la mère lors d'un baiser.

Aujourd'hui, la césarienne généralisée, l'allaitement au biberon, les bains extensifs (notamment avec des savons antibactériens), et surtout, l'utilisation d'antibiotiques ont transformé l'écologie humaine et altéré la transmission et le maintien des microbes ancestraux, affectant la composition du microbiote.

Les microbes, bons et mauvais, qui sont généralement acquis tôt dans la vie, sont particulièrement importants car ils affectent une période critique du développement.

Comparés aux Yanomami de la jungle amazonienne, qui ont une grande diversité bactérienne, les Américains ont déjà perdu 50 % de leur diversité microbienne. Pour cette raison, les risques des antibiotiques doivent être soigneusement pesés par rapport aux avantages avant qu'ils ne soient utilisés - et l'utilisation d'antibiotiques dans l'approvisionnement alimentaire doit également être considérablement réduite.

Les aliments transformés détruisent votre microbiome

Une autre attaque contre vos microbes se présente sous la forme d'aliments transformés. Les fibres sont "la partie la plus importante de l'alimentation pour nourrir le microbiome", dit Dominquez-Bello, mais elles sont largement absentes des aliments transformés. Les produits chimiques dans les aliments, tels que l'herbicide glyphosate, perturbent également les microbes.

La consommation d'aliments entiers a été associée à une plus grande diversité du microbiote intestinal, tout comme la consommation d'herbes et d'épices. La consommation de capsules d'épices - en particulier la cannelle, l'origan, le gingembre, le poivre noir et le poivre de Cayenne - a eu un effet positif sur la composition des bactéries intestinales après seulement deux semaines. Dans une autre étude, la diversité des bactéries intestinales a augmenté après quatre semaines de consommation d'herbes et d'épices à des doses de trois quarts de cuillère à café, ou 1,5 cuillère à café, par jour.

Avec les herbes et les épices, la consommation d'aliments fermentés est une autre stratégie solide pour optimiser la santé de votre microbiome intestinal. Dans une étude, 36 adultes ont été exposés à une alimentation riche en aliments fermentés ou en aliments riches en fibres pendant 10 semaines. Chez ceux qui mangeaient des aliments fermentés, la diversité du microbiome a augmenté et les marqueurs inflammatoires ont diminué.

Le problème est que de nombreux Américains ne consomment pas régulièrement ces aliments entiers et sains, mais consomment plutôt de la malbouffe transformée sans fibres, sans nutriments et avec beaucoup d'additifs. Il a également été constaté que les édulcorants artificiels altèrent négativement les bactéries intestinales.

La Voûte du Microbiote

Dominguez-Bello est président de The Microbiota Vault, une initiative mondiale à but non lucratif qui vise à « maintenir la santé à long terme de l'humanité » grâce au stockage et à la préservation d'échantillons et de collections de microbiote. L'idée est de maintenir une banque de microbes qui pourraient être utilisés pour recréer le microbiote humain lorsqu'il commence à devenir moins diversifié - ou lorsqu'il disparaît essentiellement. Dominquez-Bello a dit à People :

« Nous devons préserver la biodiversité actuelle des microbes chez les humains partout. Et cela vaut aussi pour l'environnement. Nous gâchons complètement la biodiversité, y compris la diversité microbienne. Les microbes sont essentiels dans tout écosystème, pas seulement humain, animal ou végétal, mais aussi dans les océans. L'ensemble est interconnecté par les effets de l'activité humaine.

Il faut préserver les microbes car ils affectent vraiment le fonctionnement de la terre... Ils affectent tout. Ils modulent notre propre expression génétique. Il faut donc faire plus pour conserver et restaurer la biodiversité microbienne car nous aurons besoin d'une restauration.

Afin de protéger au mieux votre microbiome, vous devez non seulement éviter les césariennes dans un avenir proche, mais également noter ce qui suit :

Faire:

  • Mangez beaucoup d'aliments fermentés - Les choix sains incluent le lassi, le kéfir d'herbe fermenté, le natto (soja fermenté) et les légumes fermentés.
  • Prenez un supplément de probiotiques – Si vous ne mangez pas régulièrement d'aliments fermentés, un supplément de probiotiques peut être utile.
  • Augmentez votre consommation de fibres solubles et insolubles , en vous concentrant sur les légumes et les graines, y compris les graines germées.
  • Salissez-vous les mains dans le jardin - L'exposition aux bactéries et aux virus dans le sol peut renforcer votre système immunitaire et fournir une immunité durable contre les maladies.
  • Ouvrez vos fenêtres - La recherche montre que l'ouverture d'une fenêtre et l'augmentation du flux d'air naturel peuvent améliorer la diversité et la santé des microbes dans votre maison, ce qui vous profite à son tour.
  • Lavez votre vaisselle à la main plutôt qu'au lave-vaisselle - des recherches ont montré que le lavage à la main retient plus de bactéries sur la vaisselle que la vaisselle au lave-vaisselle. Manger de ces plats moins que stériles peut réduire votre risque d'allergies en stimulant votre système immunitaire.

 

Éviter:

  • Antibiotiques sauf nécessité absolue. Si vous les utilisez, assurez-vous de reconstituer votre intestin avec des aliments fermentés et/ou un supplément probiotique de qualité.
  • Viande et autres produits animaux élevés de manière conventionnelle , car les animaux CAFO sont régulièrement nourris avec des antibiotiques à faible dose.
  • Eau chlorée et/ou fluorée – cela s'applique également au bain ou à la douche.
  • Aliments transformés - Un excès de sucre ainsi que des nutriments autrement «morts» nourrissent les bactéries pathogènes. Les émulsifiants alimentaires tels que le polysorbate 80, la lécithine, la carraghénine, le polyglycérol et la gomme xanthane peuvent avoir un effet négatif sur la flore intestinale.
  • Les produits chimiques agricoles , en particulier le glyphosate (Roundup), sont un antibiotique bien connu et pourraient potentiellement tuer bon nombre de vos microbes intestinaux bénéfiques si vous mangez des aliments contaminés.
  • Savon antibactérien car il tue les bonnes et les mauvaises bactéries et contribue au développement de la résistance aux antibiotiques.

 

Article au format PDF

Sources:

SOURCE : LES NOUVELLES ESPÈCES EN VOIE DE DISPARITION : LE MICROBIOME INTESTINAL HUMAIN