L'Institut de virologie de Wuhan a assemblé un génome du virus monkeypox, permettant au virus d'être identifié par le test PCR. Il a utilisé une méthode que les chercheurs ont classée comme potentiellement contagieuse, rapporte The National Pulse.

L' étude a été publiée pour la première fois en février 2022, quelques mois seulement avant la plus récente épidémie internationale de cas de monkeypox, qui semble maintenant avoir également atteint les États-Unis.

L'étude, rédigée par neuf chercheurs de l'Institut de virologie de Wuhan et publiée dans la revue trimestrielle Virologica Sinica , fait également suite à l'utilisation généralisée des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour identifier les individus positifs au COVID-19.

Les chercheurs ont apparemment réussi à identifier une partie du génome du virus monkeypox, permettant aux tests PCR de détecter le virus, déclare la publication : "Efficient Assembly of a Large Fragment of Monkeypox Virus Genome as a qPCR Template Using Dual-Selection Based". Recombinaison ( assemblage efficace d'un grand fragment du génome du virus monkeypox en tant que matrice qPCR utilisant une recombinaison associée à la transformation basée sur la double sélection )".

Les virus monkeypox - appelés "MPXV" dans l'article - ont des souches qui sont "plus pathogènes et qui infectent des personnes dans différentes parties du monde".

« L'amplification en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) est l'étalon-or pour la détection des orthopoxvirus (y compris le MPXV). Pour la détection des pan-orthopoxvirus, le gène E9L (ADN polymérase) s'est avéré être une excellente cible pour les tests qPCR. Pour la détection du MPXV, Li et al ont rapporté que le gène C3L (protéine de liaison au complément) peut être utilisé comme cible qPCR pour la souche MPXV du bassin du Congo », a indiqué le journal, avant de noter qu'en Chine, il n'y a pas assez de génétique. informations sur le virus pour la détection PCR :

Étant donné que l'infection par le MPXV n'a jamais été liée à une épidémie en Chine, le génome viral requis pour la détection par qPCR n'est pas disponible. Dans ce rapport, nous avons utilisé le TAR à double sélectivité pour assembler un fragment de génome MPXV de 55 kb couvrant E9L et C3L, deux cibles qPCR précieuses pour la détection de MPXV ou d'autres orthopoxvirus.

"Le but principal de l'assemblage d'un fragment du génome du MPXV est de fournir une matrice nucléotidique pour la détection du MPXV", indique l'étude, qui s'appuie sur le processus de recombinaison associée à la transformation (TAR) pour isoler un fragment génomique du virus monkeypox.

« En tant qu'outil efficace pour assembler de grands fragments d'ADN jusqu'à 592 kb de longueur, l'assemblage de TAR est devenu indispensable pour générer des clones infectieux de grands virus à ADN/ARN », expliquent les chercheurs.

Le document reconnaît que l'application du TAR dans la recherche en virologie pourrait également soulever des problèmes de sécurité potentiels, en particulier lorsque le produit assemblé contient un ensemble complet de matériel génétique qui peut être converti en un agent pathogène infectieux.

"Bien qu'un génome viral complet soit le modèle de référence idéal pour détecter le MPXV à l'aide de la qPCR, dans cette étude, nous n'avons tenté d'assembler qu'un fragment viral de 55 kb, soit moins d'un tiers du génome du MPXV. Ce produit d'assemblage est à sécurité intégrée car il élimine pratiquement tout risque de retour à un virus infectieux tout en fournissant plusieurs cibles qPCR pour la détection du MPXV ou d'autres orthopoxvirus », ont déclaré les chercheurs.

La nouvelle étude fait suite à l'Institut de virologie de Wuhan, qui a mené des recherches similaires sur les souches de coronavirus de chauve-souris qui pourraient infecter les humains, tout en admettant que ses installations manquaient de protocoles de sécurité de laboratoire appropriés.